Okul gazetesinde çalıştığı için yaz tatilini; yerel askeri üssün biraz dışında, söylentilere göre orada tutulduğu iddia edilen UFO gemilerini görmek umuduyla kamp yaparak geçiren Asaba Naoyuki’nin çabaları boşa çıkmıştır ve bütün yaz hiçbir şey elde edemeden geçmiştir. Tatilin son gecesi gizlice okulun yüzme havuzuna gider. Orada, kendisi dışında, Iriya Kana adında bir kızın da yüzdüğünü görünce çok şaşırır. Üstelik bu kızın bileklerine gömülü kristal toplar vardır. Yeni dönem başladığında Iriya, Asaba’nın sınıfına transfer olur. Iriya sürekli öğretmenler tarafından bir yerlere çağrılır ve bazen de olaylara çok garip tepkiler verir. Sınıftakiler onun bu davranışlarını garipseyerek uzak dururlar, Iriya da onlarla anlaşmayı başaramaz; fakat aklındakileri açabildiği Asaba’ya güvenmeye başlar. Başı her derde girdiğinde ise ortaya Enomoto adında siyah takım elbiseli bir adam çıkar. Yoksa Iriya’nın kaçamadığı ciddi bir görevi yerine getirmek gibi bir kaderi mi söz konusudur?  Sonohara adındaki bu gizemli yerel üssün sırları ve okul gazetesinin takip ettiği UFO kazası; “Black Manta”, özel bir pilot ve bir koruma biriminin varlığıyla birlikte gün ışığına çıkmaya başlar. Böylece, Iriya ve Asaba’nın “UFO Yazı” da başlamıştır.